Истражувачи од Градскиот универзитет во Хонгконг претставија метод за просторно профилирање на РНК во свежо ткиво, без потреба од секвенционирање или лабораториско умножување на генетскиот материјал. Технологијата, наречена Spectrum-FISH, користи вертикално поставени наноиглени сонди за молекуларно „допирање“ на ткивото.
За разлика од многу постојни техники на просторна омика, кои бараат сложена подготовка на примерокот, Spectrum-FISH може да се примени директно на свежо подготвено ткиво. Посебна регистрациска постапка овозможува измерените молекуларни сигнали повторно да се поврзат со конкретни структури и клетки во ткивото.
Методот бил испитан на развојни нервни ткива и мирисни луковици кај глувци, како и на свежи примероци од човечки биопсии на дебелото црево. Резултатите покажале дека со релативно едноставна обработка може да се добијат просторни информации на ниво на поединечни клетки.
Spectrum-FISH овозможува анализа на информациски РНК, микроРНК и одредени видови РНК-метилација. Тоа отвора можност за подостапно просторно проучување на регулацијата на гените, без голема зависност од скапа опрема за секвенционирање и обемна компјутерска обработка.
Истражувачите сметаат дека поедноставниот тек на работа и пониските трошоци би можеле да помогнат просторната омика постепено да се приближи до клиничката употреба. Сепак, потребни се дополнителни испитувања за да се утврди како методот ќе функционира во различни типови ткива и во рутинска дијагностичка практика. Студијата е објавена во списанието Nature Biomedical Engineering.
