Истражувачки тим од Helmholtz Munich, Техничкиот универзитет во Минхен и Biozentrum при Универзитетот во Базел разви алатка со вештачка интелигенција што го автоматизира анализирањето на клеточните мембрани во 3Д-снимки. Софтверот MemBrain v2 може работа што порано траела недели да ја заврши за само неколку часа.
Алатката е наменета за податоци добиени со крио-електронска томографија (cryo-ET), техника со која клетките се замрзнуваат речиси моментално и се набљудуваат во три димензии со многу висока резолуција. Така се зачувуваат структури од целата клетка до поединечни молекули, но делови од мембраните може да бидат тешки за препознавање поради ограничувањата на снимањето.
MemBrain v2 обединува три функции во еден систем. MemBrain-seg ги издвојува мембраните, MemBrain-pick ги пронаоѓа специфичните протеински комплекси во нив, а MemBrain-stats ја анализира нивната просторна распределба.
Во еден тест, истражувачите рачно ги означиле позициите на протеинските комплекси на само една мембрана. Врз основа на тие податоци, системот ги лоцирал истите комплекси на други мембрани со F1-оценка од 91 проценти, што укажува на висока прецизност и добра применливост на различни примероци.
За разлика од претходните алатки, кои обично обработувале само еден дел од анализата, MemBrain v2 нуди целосен работен тек и во повеќе случаи ги повторил резултатите од деталните рачни анализи. Системот е достапен како отворен код, а модулот за препознавање мембрани веќе се користи во истражувачки проекти ширум светот.
Истражувачите очекуваат алатката да овозможи обработка на поголеми сетови податоци и подетално проучување на клеточната организација. Во иднина, MemBrain v2 би можел попрецизно да разликува различни типови протеини и да помогне во откривањето што се менува во клетките при развој на болест.
