Истражувачи од Универзитетот Отаго во Нов Зеланд развија метод што овозможува систематско менување на геномот на бактериофагите — вируси што ги напаѓаат и уништуваат бактериите. Пристапот може да помогне во откривањето на функциите на досега слабо проучените фаговски гени.
Бактериофагите се разгледуваат како можен инструмент во борбата против антимикробната резистенција, но и како поодржлива алтернатива на дел од хемиските средства во земјоделството. Сепак, голем број нивни гени сè уште припаѓаат на таканаречената микробна „темна материја“, бидејќи нивната улога не е позната.
Новиот метод комбинира секвенционирање со вметнување на транспозони — подвижни делови од ДНК што можат да прекинат одреден ген — со селекција заснована на системот CRISPR-анти-CRISPR. Така научниците можат да утврдат кои гени се неопходни за преживување на фагот, а кои не се суштински.
Истражувачите покажале и дека транспозоните можат да носат дополнителни гени во фаговскиот геном. Во експериментите бил додаден флуоресцентен маркер, но истиот принцип би можел да се искористи за внесување гени што им помагаат на фагите да ги надминат одбранбените механизми на бактериите.
Ова е особено важно за проучување на биофилмовите — заедници од бактерии што се прилепуваат на површини и можат да предизвикаат тешко лекувани инфекции на импланти и медицински уреди. Со дополнително уредување, фагите би можеле полесно да ги нападнат таквите патогени.
Студијата, објавена во списанието Nature Microbiology, претставува алатка за истражување и инженерство на фагови. Нејзината директна терапевтска ефикасност допрва треба да се испита во понатамошни истражувања.
