Живите микроби, нивните ензими и остатоците од угинатите микроорганизми можат да послужат како рани показатели за здравјето на почвата и складирањето јаглерод. Истражувањето покажува и дека видот на дрвјата и покривните култури значително влијаат врз микробната активност.