Истражувачка група од Универзитетот во Сари разви брз и економичен начин за проучување на бактериските заедници кај коњите со технологијата Oxford Nanopore.
Научниците ги анализирале целосните 16S рРНК-гени во примероци од измет, плунка, кожа и млеко. Секвенционирањето било извршено во самата лабораторија со преносливиот уред MinION Mk1D, а податоците биле обработени со софтверот EPI2ME.
Резултатите покажале дека различните делови од телото имаат јасно различни бактериски заедници. Долгите секвенци, со должина од околу 1.500 базни парови, овозможиле прецизно и брзо профилирање на микробиомот.
Студијата е дел од пошироко истражување за развојот на цревниот микробиом кај ждребињата и неговата поврзаност со микробиомот на кобилите. Податоците од изметот, кожата, млекото и плунката може да помогнат во подобро разбирање на здравјето и развојот на младите коњи.
Истражувачите сметаат дека Oxford Nanopore секвенционирањето во иднина би можело да се користи и за брза идентификација на бактерии и за клиничко профилирање на микробиомот. Сепак, потребни се дополнителни истражувања пред методот да стане дел од рутинската ветеринарна дијагностика.
