Научници од Универзитетот во Калифорнија, Лос Анџелес, развија метод „клеточни села“ за проучување на тоа како генетските разлики влијаат врз растот и преживувањето на мозочните клетки.
Во една заедничка клеточна култура тие измешале нервни прогениторни клетки, добиени од десетици генетски различни донори. Така сите клетки растеле под исти услови, со што се намалувало влијанието на разликите во температурата, кислородот и ракувањето што може да се појават кога примероците се одгледуваат во одделни садови.
Истражувачите со секвенционирање на ДНК следеле колкав удел во културата имаат клетките од секој донор. Поголемиот удел со текот на времето укажувал на побрзо делење и повисока клеточна „издржливост“. За анализа на сложените податоци бил развиен и статистичкиот софтвер Townlet, кој го разликува вистинскиот биолошки ефект од математичките промени во уделите.
Методот бил применет на прашањето зошто кај дел од лицата со аутизам и делеција на регионот 16p11.2 се појавува макроцефалија, односно невообичаено голем обем на главата. Клетките од 12 лица со оваа генетска промена се делеле побрзо од клетките од 11 лица без делецијата, што упатува дека раниот прекумерен раст на мозочните клетки може да придонесе за поголем мозок.
Во поголема група од 35 донори, варијациите во брзината на растот биле поврзани со дел од ДНК во близина на генот ZFHX3, кој го ограничува клеточното делење во мозокот во развој. Резултатот бил потврден и во независна група донори.
Истражувачите проучувале и како клетките реагираат на олово, невротоксин што може да се најде во стара боја, водоводни линии и загадена почва. По една недела изложеност, падот на преживувањето се движел од околу 20 до 90 проценти, зависно од донорот. Дел од разликата била поврзана со регионот во близина на генот ARNT2, кој учествува во заштитата на клетките од стрес.
Авторите сметаат дека „клеточните села“ можат да помогнат во создавање поширок атлас на генетски условената ранливост кон болести и штетни изложувања. Јавно достапниот Townlet би можел да им овозможи на други истражувачи да го применат пристапот и на други типови клетки и токсични влијанија.
































