Научници од Универзитетот во Манчестер и Институтот за дизајн на протеини демонстрираа ензим создаден со помош на вештачка интелигенција, наменет за сложен чекор во производството на лекови.
Истражувачите го употребиле новиот генеративен модел RFD4-Proteina, развиен од Институтот за дизајн на протеини во соработка со NVIDIA. Моделот истовремено ги разгледува аминокиселинската низа, тродимензионалната структура на протеинот и молекулите со кои тој стапува во интеракција.
Еден од најзначајните тестови бил поврзан со синтезата на ленкапавир, лек што се користи за превенција од ХИВ. Моделот предложил целосно нови ензими способни да катализираат создавање на амидна врска, важна реакција во производството на овој лек.
Од 67 дизајни избрани за лабораториско тестирање, четири покажале јасна активност. Најуспешниот ензим претворил 79 проценти од обемниот хирален амин во посакуваниот амиден производ, при што првенствено го избирал потребниот S-енантиомер.
Реакцијата е особено тешка бидејќи ензимот мора да ја поттикне саканата реакција, а истовремено да спречи конкурентна реакција со вода, која во ваквите процеси ја има во голем вишок.
RFD4-Proteina ги комбинира моделите RosettaFold Diffusion и Proteina-Complexa. Според компјутерските тестови, тој постигнува стапки на успех пет до десет пати повисоки од претходните модели и создава кандидати со пет до десет пати поголема брзина.
Моделот анализира голем број можни протеински решенија во виртуелна средина, а потоа им овозможува на научниците во лабораторија да ги тестираат најперспективните кандидати. Тој е објавен како софтвер со лиценца BSD-3, што им дозволува на други истражувачи да го користат и да го надградуваат.
Резултатите, објавени како претпечат, претставуваат доказ дека ензими за сложени фармацевтски реакции можат да се дизајнираат со компјутерски модели. Пристапот би можел да го забрза развојот на лекови, антитела, дијагностички молекули и поодржливи индустриски процеси, иако се потребни дополнителни испитувања пред практична примена.
